Код

МетаДата = СоздатьОбъект("MetaDataWork");
МетеДата.ПрисоединитьМД(ПутьМД);
идВидаСпрМатериалы = МетаДата.ИДСправочника("Материалы");

//тогда запрос по остаткам должен выглядеть примерно так (ТОЛЬКО для элементов из спр-ка материалов):

ТекстЗапроса = "
	     |SELECT
	     |	Спр.ID AS Мат,
	     |	Спр.Descr as Наим,
	     |	Ррег.КолвоОст AS Колво
	     |FROM
	     |	$Справочник.Материалы as Спр
	     |
	     |LEFT JOIN
	     //| INNER JOIN
	   |		(SELECT
	     |		   $Рег.Мпз AS РегМПЗ,
	     |		  $Рег.МестоХранения AS Склад,
	     |		  $Рег.Количество AS КолвоОст
	     |		 FROM
	     |			$РегистрИтоги.МестаХранения as Рег
	     |		 WHERE
	     |			(period = :ДатаПериодаОстатков~~)) AS Ррег
	     |	  ON ("+идВидаСпрМатериалы+" + Спр.ID) = Ррег.РегМПЗ
	     |WHERE
	     |	Спр.Code IN " + УсловиеМат + "";