С помощью конструктора запросов 1С++ получаю:
|SELECT
     |        ЖесткийРезервОстатки.Клиент [Клиент $Справочник.Контрагенты]
     |      , НомерУбытка.PARENTEXT [Авто $Справочник.Автомобили]
     |      , ЖесткийРезервОстатки.НомерУбытка [НомерУбытка $Справочник.НомерУбытка]
     |      , ЖесткийРезервОстатки.РезервТовараОстаток Наличие
     |      , РезервыТоваровОстатки.РезервТовараОстаток Резерв
     |FROM $РегистрОстатки.ЖесткийРезерв(:КонДата~,
     |      INNER JOIN $Справочник.НомерУбытка AS НомерУбытка ON НомерУбытка = НомерУбытка.ID,,,) AS ЖесткийРезервОстатки
     |      FULL OUTER JOIN $РегистрОстатки.РезервыТоваров(:КонДата~,,,
     |            (Товар, Клиент, НомерУбытка),) AS РезервыТоваровОстатки
     |            ON ЖесткийРезервОстатки.Клиент = РезервыТоваровОстатки.Клиент AND ЖесткийРезервОстатки.Товар = РезервыТоваровОстатки.Товар AND ЖесткийРезервОстатки.НомерУбытка = РезервыТоваровОстатки.НомерУбытка
     |      INNER JOIN $Справочник.НомерУбытка AS НомерУбытка ON ЖесткийРезервОстатки.НомерУбытка = НомерУбытка.ID";

Выдает:
{D:\BASE77NEW\РЕЗЕРВЫЗАПЧАСТЕЙ.ERT(25)}: State 42000, native 170, message [Microsoft][ODBC SQL Server Driver][SQL Server]Line 14: Incorrect syntax near '.'.

Отладка выдает:
SELECT
       ЖесткийРезервОстатки.Клиент [Клиент $Справочник.Контрагенты]
     , НомерУбытка.PARENTEXT [Авто $Справочник.Автомобили]
     , ЖесткийРезервОстатки.НомерУбытка [НомерУбытка $Справочник.НомерУбытка]
     , ЖесткийРезервОстатки.РезервТовараОстаток Наличие
     , РезервыТоваровОстатки.РезервТовараОстаток Резерв
FROM (
select
rg6860_vt.sp6863 as Клиент,
rg6860_vt.sp6861 as Товар,
rg6860_vt.sp6864 as НомерУбытка,
rg6860_vt.sp6865 as РезервТовараОстаток
from rg6860 as rg6860_vt (nolock)
INNER JOIN sc6849 AS rg6860_vt.sp6864 ON rg6860_vt.sp6864 = rg6860_vt.sp6864.ID
where rg6860_vt.period={d '2009-09-01'}
and (
rg6860_vt.sp6865 <> 0
)
) as ЖесткийРезервОстатки
     FULL OUTER JOIN (
select
rg620_vt.sp621 as Товар,
rg620_vt.sp5565 as Клиент,
rg620_vt.sp6787 as НомерУбытка,
sum(rg620_vt.sp623) as РезервТовараОстаток
from rg620 as rg620_vt (nolock)
where rg620_vt.period={d '2009-09-01'}
group by
rg620_vt.sp621,
rg620_vt.sp5565,
rg620_vt.sp6787
having
sum(rg620_vt.sp623) <> 0
) as РезервыТоваровОстатки
           ON ЖесткийРезервОстатки.Клиент = РезервыТоваровОстатки.Клиент AND ЖесткийРезервОстатки.Товар = РезервыТоваровОстатки.Товар AND ЖесткийРезервОстатки.НомерУбытка = РезервыТоваровОстатки.НомерУбытка
     INNER JOIN sc6849 AS НомерУбытка ON ЖесткийРезервОстатки.НомерУбытка = НомерУбытка.ID

Есть подозрение что ругается в INNER JOIN на двойные точки, но это преобразование (или все же моя ошибка в соединении запросов?)
Помогите кто сталкивался...

Это баг 1С++. Поменяй алиас справочника НомерУбытка.

Если в конструкторе, то стать на справочник в списке таблиц, нажать сверху кнопку "Изменить алиас" (или как она там ?) и набрать что-то, не совпадающее ни с одним из атрибутов регистра.

Проверил, проходит

ОГРОМНОЕ СПАСИБО!