так 1сpp работает на клиенте а sql2008  это сервер.
Так что если заработает то все будет ок.
Но может быть много подводных камней как со стороны sql
так и со стороны 1с.
Например Когда разбирался с sql2005 sql был сгенерирован с очень малым приращением новых  страниц тормоз был еще тот пока не нашел

Плюсы  2008
1. 64 разрядность если у Вас в сервере памяти под sql больше 4
то выигрыш в скорости, производительности,масштабируемости.
2. Положив на этот сервер рядом доп базу в формате 100
и связав ее отношениями с 1с базой сможете делать запросы с новым оптимизатором и новыми командами t-sql

Минусы
Лучший враг хорошего.Работает не трожь.
Т.е. когда и где найдете грабли неизвестно.
Одна из основных причин Новый оптимизатор запросов и режим базы 80 все таки идет эмуляция оптимизатора запросов. ( это ИХМО)
Вот тут и можем получить грабли т.е. запрос супер работает под 2000 смотрим во что он превращается в 2005,2008 и ужас.
Пришел к выводу что работает в режиме именно эмуляции
потому что сервер 2005 база в формате 80 мы например
все равно можем добавить в некластерный индекс другие значения полей. Также если сервер 2005 меняем формат базы с 80
на 90 ( или обратно ) занимает несколько секунд и не зависит
от объема базы т.е. меняются только небольшие служебные данные а таблицы пользователей теже.

Т.е. если четко знаешь почему и зачем переходишь то вполне можно пробовать.(Мы еще не созрели пока для sql2008)

Также идея перехода очень помогает УРБД.
Скажем одну переф базу сгенерить под 2000
Другую под 2008.Два сервера. Каждые два часа обменивать.
Все работают с sql2008
Если что-то происходить из ряда вон то просто оключаешь
каталог базы 2008 и включаешь каталог 2000.
Все все дальше работают под sql2000 пока не разберешься с проблемой.