Это мы в курсе... Мне бы для MSSQL такой ход.

Решил задачу вот так. Посмотрите, все ли правильно, может чего не хвататет, а может что и лишнее:

DECLARE
  @ID			numeric(5),
  @ArticleID	numeric(6),
  @Barcode		varchar(30),
  @Size			numeric(15,3),
  @isDel		bit

DECLARE i_Barcode_cursor INSENSITIVE CURSOR
  FOR SELECT * FROM i_Barcode
OPEN i_Barcode_cursor
FETCH NEXT FROM i_Barcode_cursor
  INTO @ID,@ArticleID,@Barcode,@Size,@isDel
WHILE @@FETCH_STATUS = 0
BEGIN
  IF EXISTS (SELECT * FROM Barcode WHERE ID = @ID AND ArticleID = @ArticleID)
    UPDATE Barcode SET Barcode = @Barcode, Size = @Size, isDel = @isDel, isNew = 1, isUpdate = 0 WHERE ID = @ID AND ArticleID = @ArticleID
  ELSE
    INSERT Barcode VALUES (@ID,@ArticleID,@Barcode,@Size,@isDel,1,0)
  FETCH NEXT FROM i_Barcode_cursor
    INTO @ID,@ArticleID,@Barcode,@Size,@isDel
END
CLOSE i_Barcode_cursor
DEALLOCATE i_Barcode_cursor
GO 

А как без курсора?  

Ну в смысле, как без курсора понятно, Вадимко привел решение. Я имею в виду как без курсора в моем решении?

Действительно...

По поводу решения в #1, я его и использовал. Но вот меня смутило применение WHERE ID IN (Select ID From А),  что то не допер я, что условие в join надо вынести

з.ы. Сравнил статистику обоих запросов. С курсорами оказывает фигня получается.

                                               Курсор             berezdetsky
Время выполнения клиента      12:25:11            12:24:42            
Статистика по профилю запроса                              
 Количество инструкций INSERT, DELETE и UPDATE      1408            2            705.0000
 Строки, изменяемые инструкциями INSERT, DELETE и UPDATE      1408            1408            1408.0000
 Количество инструкций SELECT      1410            0            705.0000
 Строк, возвращенных инструкциями SELECT      1408            0            704.0000
 Количество транзакций      1408            2            705.0000
Сетевая статистика                              
 Количество циклов обращения к серверу      1            1            1.0000
 TDS-пакетов отправлено клиентом      1            1            1.0000
 TDS-пакетов получено с сервера      19            1            10.0000
 байтов отправлено клиентом      1656            1054            1355.0000
 байтов получено с сервера      76238            41            38139.5000
Статистика по времени                              
 Время обработки клиента      1933            0            966.5000
 Общее время выполнения      2042            218            1130.0000
 Время ожидания при ответе сервера      109            218            163.5000

Это только в MYSQL, ну может еще где есть. А вот в MSSQL такого нема Самому не хватает конструкции:

REPLACE INTO summ (id,date,summa) VALUES ($id,$date,$value) 

Вставка замена по ключу в MYSQL...