В базе присутствуют прямые запросы по регистру остатков (включая виртуальные таблицы).

Придется переписывать запросы, если в регистре измерение сделать реквизитом?

Ну вообще-то автор не ставит вопрос "как изменить".
Он говорит про то, что изменится структура регистра.
Отвечаю:
Цитата:

Да - прийдется!

Если запросы используют виртуальные таблицы 1С++, которые разворачиваются впоследствии в использование UNION конструкций с присоединением таблиц итогов (RG###) то при изменении измерения на реквизит поле исчезнет из таблицы итогов и соответственно фильтровать или каким либо образом использовать его в виртуальной таблице итогов неполучится ....

Сам когда то написал запросы которые в своей работе используют только таблицу движений регистра... и был счастлив. Потом открыл для себя виртуальные таблицы (а точнее сам себе доказал что объединение таблицы итогов и движений работает быстрее) и тоже был рад... но когда не смог перевести старый запрос на запрос с использованием виртуальных таблиц (как раз по причине использования при получении итогов реквизитов регистра) - то был очень огорчен.