Спасибо за подсказку,
вся прична в том, что я пользовался старыми мануалами, кстати и драйвер фокспро тоже пришлось обновить, да и 1С++ тоже придется переходить с 1.8.1.6 на 2.0.3.3.
Начинаю дополнять запрос и снова затык на простой вещи, просто добавил
INNER JOIN $Справочник.Номенклатура Спр on Спр.[id] = $РегОстатков.Товар
и снова ругается
FAILED! ICommandText::Execute(): Syntax error.

	| Спр.CODE  as Код,
	|	$РегОстатков.Товар as [Товар $Справочник.Номенклатура],
	|	$РегОстатков.ОстатокТовара as ОстатокТовара
	|	FROM
	|		$РегистрИтоги.ОстаткиТоваров as РегОстатков
	| INNER JOIN $Справочник.Номенклатура Спр on Спр.[id] = $РегОстатков.Товар
	|   WHERE
		|   $РегОстатков.Товар IN (SELECT Val FROM "+СписокТМЦД+")
	| Order BY $РегОстатков.Товар
 

Убери квадратные скобки в Спр.[id]

Вот еще, отказывается работать
     | GROUP BY
     |  $РегОстатков.Товар
пишет SQL: GROUP BY clause is missing or invalid.

     | Спр.CODE  as Код,
     |      $РегОстатков.Товар as [Товар $Справочник.Номенклатура],
     |      SUM($РегОстатков.ОстатокТовара) as ОстатокТовара
     |      FROM
     |            $РегистрИтоги.ОстаткиТоваров as РегОстатков
     | INNER JOIN $Справочник.Номенклатура Спр on Спр.id = $РегОстатков.Товар
     |   WHERE
           |   $РегОстатков.Товар IN (SELECT Val FROM "+СписокТМЦД+")      
     | Order BY
     |  $РегОстатков.Товар 


вываливается с ошибкой
SQL: GROUP BY clause is missing or invalid.

посто ради проверки вместо  Order BY  ставил GROUP BY
вываливается с тойже ошибкой

Именно на таком коде вываливается ошибка.
А зачем группировка по коду?

Спасибо, только вместо  GROUP BY  Товар,Код  пришлось поставить GROUP BY  $РегОстатков.Товар,Спр.CODE.
А так заработало.
Просто на SQL версиях я всегда пользовался виртуальными таблицами, а для dbf их в чистом виде нет.

Упс, не заметил вторую страницу, удаляюсь...